因病自动离职是否有补偿金、是否合法，需结合具体情况判断。一般而言，员工因个人原因（含生病）主动辞职，通常无经济补偿金，此行为合法。
- 若员工因自身疾病完全自愿辞职，且用人单位无违法或过错情形，辞职合法，无权主张经济补偿金。因自动离职是员工主动放弃劳动关系，不符合法定补偿条件。
- 若员工“自动离职”非自愿，而是因用人单位未按约定提供劳动保护或条件、未及时足额支付报酬、未依法缴纳社保等法定过错，导致其因病离职，员工有权要求经济补偿金，此时离职行为合法，是对用人单位违法行为的正当回应。
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因病自动离职时，员工若操作不当可能影响自身权益。
1、未书面提交辞职申请或未保留证据：部分员工口头离职后即离岗，或书面申请未留存副本/无用人单位签收凭证。纠纷发生时，员工难以证明离职时间和原因，用人单位也可能否认收到申请，员工易陷入不利境地。
2、忽视医疗期规定盲目离职：员工因病需休息时，若不清楚医疗期规定，在医疗期未满、身体未恢复时急于离职。须知医疗期内员工有权享受病假工资，且用人单位不得随意解除劳动合同，盲目离职可能丧失应有权益。
3、未办理工作交接：员工自动离职时可能不配合交接工作。但工作交接是员工义务，若因未交接给用人单位造成损失，员工需承担赔偿责任。
若您在因病自动离职中已出现上述错误操作，或担心操作不当影响权益，建议尽快咨询我，我会为您提供解决方案和补救建议。
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关于因病自动离职是否有补偿金，可依据《中华人民共和国劳动合同法》相关规定分析。
《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条规定了用人单位应支付经济补偿的情形，其中包括劳动者依照第三十八条解除劳动合同的情况。第三十八条明确了劳动者可解除劳动合同的情形，如用人单位未按约定提供劳动保护或条件、未及时足额支付报酬、未依法缴纳社保等。
在因病自动离职中，若员工因用人单位存在上述第三十八条规定的过错情形而因病离职，员工离职行为符合第三十八条，用人单位应支付经济补偿。反之，若员工仅因自身疾病，在用人单位无过错情况下自愿辞职（即《劳动合同法》第三十七条规定的提前通知解除），用人单位无需支付经济补偿。
因此，因病自动离职是否有补偿金，关键在于员工离职原因是否符合《劳动合同法》第四十六条规定的补偿情形。
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处理因病自动离职的补偿金及合法性问题时，特殊情况或例外情形会影响结果：
1、医疗期内用人单位违法解除劳动合同后员工自行离职：若员工尚在法定医疗期内，且能胜任原工作或用人单位另行安排的工作，用人单位却违法解除劳动合同，员工此时自行离职，不同于普通自动离职。员工有权要求违法解除劳动合同的赔偿金（非一般经济补偿金），处理方式和赔偿金额与单纯自动离职有显著区别。
2、员工患职业病（因工作原因导致）：若员工疾病经鉴定为职业病，其离职可能涉及工伤问题。此时员工不仅可能享有医疗费、伤残补助金等工伤保险待遇，离职时能否获得经济补偿金，需结合工伤认定结果、劳动能力鉴定等级及用人单位是否存在过错等综合判断，处理流程和依据更复杂，已非简单因病自动离职问题。
3、用人单位未依法缴纳社保致员工因病无法享受医保待遇而离职：此时员工离职与用人单位未缴社保直接相关，属于用人单位过错。员工有权依据《劳动合同法》第三十八条要求解除劳动合同并获得经济补偿金，与员工单纯因自身疾病自愿离职的处理结果完全不同，用人单位的违法行为是关键影响因素。

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