您咨询的公司被收购后新公司调整结构是否合法的问题，需结合具体情况判断。
公司被收购后新公司调整结构在符合法定程序和条件时是合法的。
1. 若新公司调整结构已通过股东会/股东大会决议：根据《公司法》规定，公司重大事项需经股东会决议，若收购后调整结构（如分立、合并、业务重组）已履行股东会表决程序，且符合公司章程和法律规定，则程序合法。
2. 若调整结构未侵害股东、员工合法权益：若调整未违反劳动合同约定（如随意调岗降薪）、未损害股东知情权/表决权（如未提前通知股东），且符合《劳动合同法》《公司法》对相关主体权益的保护条款，则实体合法。
3. 若涉及国有资产收购后的结构调整：需符合《企业国有资产法》规定，履行资产评估、审批程序，确保国有资产不流失，此时调整结构需额外满足国资监管要求。
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公司被收购后新公司调整结构，存在一些特殊情况或例外情形，会对处理结果产生影响。
1. 政府主导的收购项目：若公司收购是政府主导的产业整合项目，新公司调整结构可能享受特殊政策支持，如简化审批流程、获得税收优惠等，但需严格遵循政府发布的项目实施方案，若偏离方案要求，可能失去政策支持并面临合规处罚。
2. 收购协议约定限制调整条款：若收购协议中明确约定新公司在一定期限内不得调整特定业务结构，或调整需经原股东同意，新公司违反该约定进行调整，需承担违约责任，原股东可依据协议要求赔偿损失。
3. 涉及上市公司的结构调整：若新公司为上市公司，调整结构需遵守证券法对信息披露的规定，及时向公众披露调整方案、影响等信息，未履行披露义务可能被证券监管部门处罚，影响公司资本市场形象。
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针对公司被收购后新公司调整结构的合法性，可依据相关法律规定进行分析。
根据《中华人民共和国公司法》第三十七条，股东会行使“决定公司的经营方针和投资计划”“对公司合并、分立、解散、清算或者变更公司形式作出决议”等职权。若新公司调整结构属于上述股东会职权范围，且已通过股东会决议，则符合该条款对公司治理程序的要求。同时，《中华人民共和国劳动合同法》第三十四条规定“用人单位发生合并或者分立等情况，原劳动合同继续有效，劳动合同由承继其权利和义务的用人单位继续履行”，若调整结构涉及员工岗位变动，需确保不违反该条款对员工劳动合同权益的保护。综上，若新公司调整结构履行了股东会决议程序，且未违反劳动合同法等相关法律对第三方权益的保护，则具有合法性。
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公司被收购后新公司调整结构，可能存在以下法律风险点。
1. 结构调整无效风险：例如，新公司收购某民营企业后，未召开股东会便决定将公司业务分立为两个子公司，股东以未履行决策程序为由诉至法院，法院可能依据公司法判决该分立行为无效，导致新公司前期结构调整投入的资源浪费。
2. 劳动纠纷风险：例如，新公司因结构调整将原技术部门员工调至销售岗位，未与员工协商一致，员工以公司违法变更劳动合同为由申请劳动仲裁，仲裁委可能裁决公司恢复原岗位或支付经济赔偿金，影响公司正常经营秩序。

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